《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果，菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄。菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先，最后帮助他们打败了 火龙果，并顺利回到 现代。